Apa yang kita ketahui sejauh ini tentang sub-varian Omicron baru

Kasus varian SARS-CoV-2 Omicron telah meningkat secara global selama dua bulan terakhir, dengan banyak negara mengalami puncak yang lebih tinggi dari varian sebelumnya.

Sekarang kita melihat kasus dari sub-varian Omicron, yang dikenal sebagai BA.2, muncul.

Daripada putri dari varian Omicron BA.1 (atau B.1.1.529), lebih bermanfaat untuk menganggap BA.2 sebagai saudara perempuan Omicron.

Apa itu varian?

Virus, dan khususnya virus RNA seperti SARS-CoV-2, membuat banyak kesalahan saat mereka bereproduksi. Mereka tidak dapat memperbaiki kesalahan ini, sehingga mereka memiliki tingkat kesalahan yang relatif tinggi, atau mutasi dan terus berkembang.

Ketika kode genetik virus berubah sebagai akibat dari mutasi ini, itu disebut sebagai varian.

Omicron adalah varian “sangat berbeda”, setelah terakumulasi lebih dari 30 mutasi dalam protein paku. Ini telah mengurangi perlindungan antibodi dari infeksi dan vaksinasi sebelumnya dan meningkatkan penularan.

Mengklasifikasikan varian

Jika perubahan kode genetik dianggap berpotensi memengaruhi sifat virus yang membuatnya lebih berbahaya, dan ada minat penularan yang signifikan di banyak negara, itu akan dianggap sebagai “varian”.

Jika varian yang diinginkan kemudian terbukti lebih menular, menghindari perlindungan dari vaksinasi atau infeksi sebelumnya, dan/atau berdampak pada kinerja tes atau perawatan, itu diberi label “varian yang menjadi perhatian”.

Organisasi Kesehatan Dunia mengklasifikasikan Omicron sebagai varian kekhawatiran pada 26 November karena potensinya menyebabkan tingkat infeksi ulang yang lebih tinggi, peningkatan penularan, dan pengurangan perlindungan vaksin.

Garis keturunan Omikron

Garis keturunan, atau sub-varian, adalah kelompok varian virus yang terkait erat secara genetik yang berasal dari nenek moyang yang sama.

Varian Omicron terdiri dari tiga sub-garis keturunan: B.1.1.529 atau BA.1, BA.2 dan BA.3.

Sementara WHO belum memberikan klasifikasi terpisah BA.2, Inggris Raya telah berlabel BA.2 varian “sedang diselidiki”. Jadi belum varian minat atau perhatian, berdasarkan definisi WHO, tapi yang diawasi ketat.

Ini bukan varian pertama yang memiliki sub-garis keturunan. Akhir tahun lalu, Delta “plus” atau AY.4.2 dilaporkan secara luas, kemudian Omicron datang.

Membedakan BA.2

Sedangkan urutan pertama BA.2 adalah dikirim dari Filipina – dan kita sekarang telah melihat ribuan kasus, termasuk di Amerika Serikat, Inggris dan beberapa di Australia – asalnya masih belum diketahui.

Sifat pasti BA.2 juga masih diselidiki. Sementara ada tidak ada bukti sejauh ini bahwa itu menyebabkan penyakit yang lebih parahpara ilmuwan memiliki beberapa kekhawatiran khusus.

1. Lebih sulit untuk membedakan

Penanda yang membantu membedakan Omicron (BA.1) dari varian lain pada tes PCR adalah adanya gen S, yang dikenal sebagai “kegagalan target gen S”. Tapi ini tidak berlaku untuk BA.2.

Ketidakmampuan untuk mendeteksi garis keturunan ini dengan cara ini telah menyebabkan beberapa orang melabelinya sebagai “sub-varian siluman”.

Namun bukan berarti kita tidak bisa mendiagnosis BA.2 dengan tes PCR. Itu hanya berarti ketika seseorang dites positif untuk SARS-CoV-2, kita perlu sedikit lebih lama untuk mengetahui varian mana yang bertanggung jawab, melalui pengurutan genom. Ini adalah kasus dengan varian sebelumnya.

2. Mungkin lebih menular

Mungkin yang paling mengkhawatirkan adalah bukti yang muncul BA.2 mungkin lebih menular daripada Omicron asli, BA.1.

SEBUAH studi pendahuluan dari Denmarkdi mana BA.2 sebagian besar telah menggantikan BA.1, menunjukkan BA.2 meningkatkan kerentanan orang yang tidak divaksinasi terhadap infeksi lebih dari dua kali lipat jika dibandingkan dengan BA.1.

Para peneliti menyarankan orang yang divaksinasi lengkap 2,5 kali lebih rentan terhadap BA.2 daripada BA.1, dan mereka yang divaksinasi booster hampir tiga kali lebih rentan.

Studi ini memeriksa lebih dari 2.000 kasus rumah tangga utama BA.2 untuk menentukan jumlah kasus yang muncul selama masa tindak lanjut tujuh hari.

Para peneliti juga memperkirakan tingkat serangan sekunder (pada dasarnya, kemungkinan infeksi terjadi) menjadi 29% untuk rumah tangga yang terinfeksi BA.1 versus 39% untuk mereka yang terinfeksi BA.2. Studi Denmark ini masih pracetak, artinya belum diperiksa oleh ilmuwan independen, sehingga penelitian lebih lanjut diperlukan untuk memastikan apakah BA.2 benar-benar lebih menular daripada BA.1.

Varian masa depan

Kita harus mengharapkan varian, sub-varian, dan garis keturunan baru untuk terus muncul. Dengan tingkat penularan yang begitu tinggi, virus memiliki peluang yang melimpah untuk berkembang biak dan kesalahan atau mutasi terus muncul.

Cara untuk mengatasinya, tentu saja, adalah dengan mencoba memperlambat penularan dan mengurangi kumpulan inang yang rentan di mana virus dapat dengan bebas bereplikasi.

Strategi seperti jarak sosial dan pemakaian masker, serta meningkatkan tingkat vaksinasi secara global, akan memperlambat munculnya varian dan garis keturunan baru.

Paul Griffin adalah Associate Professor, Penyakit Menular dan Mikrobiologi di The University of Queensland.

Artikel ini pertama kali muncul di Percakapan.