IIT Mandi mengungkapkan detail struktural unik dari virus COVID-19

Sebuah tim peneliti dari Indian Institute of Technology Mandi (IIT Mandi), yang dipimpin oleh Dr Rajanish Jiri, Associate Professor di College of Basic Sciences, telah menjelaskan bagian dari struktur protein utama dalam virus COVID-19, membantu untuk memahami cara kerjanya dan perannya dalam penyebaran, keparahan dan perkembangan penyakit Pengobatan antivirus.

Temuan tim baru-baru ini diterbitkan dalam Penelitian Terkini dalam Ilmu Virologi, dalam makalah yang ditulis bersama oleh Dr. Jerry dan peneliti, Amit Kumar, Ankur Kumar dan Pratik Kumar, bersama dengan Dr. Neha Garg dari Banaras Hindu. Universitas.

Virus ini mengandung enam belas protein non-struktural (NSP1 – NSP16), di mana NSP1 berperan penting dalam patogenesis (kemampuan untuk menyebabkan penyakit) virus. NSP1 mengganggu protein sel inang dan menekan fungsi kekebalannya. Kepentingannya dapat dipahami dengan fakta bahwa ia juga disebut “agen penghenti host”.

Secara khusus, para peneliti menemukan bahwa jika daerah terminal-C dari NSP1, yaitu 131–180 residu dari NSP1, telah dihilangkan, maka NSP1 tidak dapat menghentikan penerjemahan oleh ribosom. Oleh karena itu, penting untuk memahami mekanisme molekuler, interaksi biofisik, dan kimiawi interaksi NSP1 dengan sel inang.

Tim IIT Mandi secara eksperimental mempelajari konformasi struktural SARS-CoV-2 NSP1 dalam berbagai kondisi – dalam pelarut organik, lingkungan membran meniru, dan dalam liposom. Dengan menggunakan teknik analitik seperti spektroskopi melingkar dichroic, spektroskopi fluoresensi, dan simulasi dinamika molekul, para peneliti mendemonstrasikan perubahan dinamis dalam modulasi IDR dari NSP1, sebagai respons terhadap lingkungannya, karena interaksi hidrofobik dan elektrolit statis antara protein dan lingkungan. .

“Temuan kami memberikan wawasan tentang pengaturan gangguan C NSP1 (residu 131-180) perifer untuk SARS-COV2 di lingkungan yang berbeda, yang akan membantu dalam memahami aspek NSP1 yang lebih luas dan interaksinya dengan mitra pengikat yang saat ini tidak diketahui,” kata Dr. Jerry.

Memahami struktur dan fungsi konformasi yang terkait dengan protein virus utama seperti NSP1 pada akhirnya dapat membantu mengembangkan terapi yang dapat menargetkan protein ini dan menghentikan virus di jalurnya.